As relações entre a fauna aquática e o ambiente imediato são estudadas em cada igarapé, incluindo características da água, a estrutura do riacho (por exemplo, largura, profundidade, velocidade da correnteza) e do ambiente de entorno (cobertura vegetal, tipo de vegetação marginal, topografia).

Em destaque as drenagens onde estão sendo realizadas amostragem

Em uma escala ainda mais ampla, estudos estão sendo conduzidos nas principais drenagens da bacia amazônica. Neste caso, o objetivo é analisar as relações entre as características ambientais e faunísticas dos igarapés e suas características geomorfológicas, paisagísticas e históricas, bem como a conectividade entre essas bacias de drenagem.

A floresta Amazônica é recortado por uma complexa rede de riachos.